网商贷逾期扣款流程如下：

1. 核对欠款总额：银行会核对使用者的当前欠款总额，涵逾期利息和违约金。

2. 自动扣款顺序：网商贷逾期后，系统会依照以下顺序自动扣款：

- 先从支付宝账户余额扣除。

- 若是余额不足会从余额宝中扣除。

- 若余额宝也不足，系统会尝试从绑定的银行卡中扣除。

3. 罚息计算：逾期一天的罚息一般是依照原利息的1.5倍计算，逾期金额越多，产生的罚息也越多。

4. 扣款时间：网商贷一般在还款日的中午12点自动发起扣款，若自动扣款失败客户需在当天24:00前手动还款，以免产生逾期记录。

5. 逾期作用：逾期除了产生罚息外还可能作用个人记录对未来的贷款和信用活动造成不利作用。